سفیر ایران در روسیه نوشت: حمله به تأسیسات هسته‌ای ایران از سوی نظام سلطه [غرب]به رهبری آمریکا، حذف عقلانیت، تضعیف منطق مذاکره و بی‌معنا کردن سازوکار‌های نظارتی و حقوقی است.
وزارت بهداشت، درمان و آموزش پزشکی با صدور اطلاعیه‌ای ضمن محکومیت تجاوز نظامی آمریکا به تاسیسات هسته‌ای ایران، اعلام کرد که هیچ‌گونه آلودگی پرتویی در مناطق مجاور تأسیسات هسته‌ای گزارش نشده است.
وزیر امور خارجه کشورمان گفت: برنامه هسته‌ای ایران، وارداتی نیست که با بمباران از بین برود. این برنامه، نتیجه دانش و فناوری بومی دانشمندان ایرانی است، علم را نمی‌توان با بمباران نابود کرد.
سخنگوی سازمان انرژی اتمی گفت: این اولین بار نیست که به صنعت هسته‌ای کشور خسترت وارد می‌شود ما قبلا هم خسارت‌هایی که وارد شده است را جبران کردیم و با توجه به توانی که داریم این صنعت ادامه پیدا می‌کند.
معاون تحقیقات و فناوری وزارت بهداشت، درمان و آموزش پزشکی گفت: ما ایرانی‌ها دارای تفکرات و عقاید سیاسی مختلف هستیم، اما آن چیزی که همه ما را با هم پیوند می‌زند، وطن و خاک است و برهمین اساس هیچ حادثه‌ای نتوانسته فعالیت‌های آموزشی و پژوهشی دانشگاه‌های کشور را مختل کند.
عضو هیأت رئیسه کمیسیون امنیت ملی و سیاست خارجی مجلس شورای اسلامی با تاکید بر توان بالای ایران برای حمله به منافع آمریکا در داخل منطقه و خارج از آن، گفت: به‌رغم ترور ناجوانمردانه دانشمندان هسته‌ای یا شلیک موشک‌های چند تنی، این تاسیسات نابود شدنی نیست.
سازمان انرژی اتمی ایران در نامه‌ای به مدیرکل آژانس بین‌المللی انرژی اتمی خواستار رسیدگی به اقدام خلاف قوانین بین‌المللی آمریکا در حمله به تاسیسات هسته‌ای کشورمان شد.