باشگاه خبرنگاران جوان - مارکار آقاجانیان به عنوان سرمربی باشگاه لرنیان آرتساخ در سطح دوم فوتبال ارمنستان انتخاب شد.
او سال‌ها دستیار کارلوس کی روش در تیم ملی فوتبال ایران بود و تجربه حضور در جام جهانی را نیز در کارنامه خود دارد. آقاجانیان همچنین در نخستین دوره سرمبیگری امیرقلعه نویی در تیم ملی نیز دستیار او بود.
آخرین تجربه سرمربیگری آقاجانیان به ۱۳ سال پیش در تیم داماش تهران برمی گردد.
رسانه رسمی باشگاه لرنیان آرتساخ نوشت: با کمال خوشحالی به اطلاع می‌رسانیم که مارکار آقاجانیان هدایت تیم آرتساخ کوهستان را به عهده گرفته است. متخصص ۶۰ ساله که تجربه کار در تیم‌های المپیک و جوانان ایران را دارد در طول دوران باشگاهی خود در فعالیت مربیگری در تیم‌های ایرانی حضور داشته است.