بسیاری از کارشناسان صنعت دام و طیور اذعان می‌کنند که مشکلات تخصیص ارز و عرضه نهاده در سامانه بازارگاه بالاتر از نرخ مصوب چالش‌هایی را برای تولیدکنندگان ایجاد کرد که در نهایت منجر به التهاب بازار محصولات پروتئینی و اعتراض تولیدکنندگان شده است.
معاون امور تولیدات دامی وزارت جهاد گفت: بنابر پیگیری‌های صورت گرفته شاهد افزایش میزان بارگذاری نهاده‌ها در سامانه بازارگاه خواهیم بود که براین اساس مشکل به‌زودی مرتفع خواهد شد.
نهاوندی گفت: در حال حاضر تعدادی از شرکت‌های عمدتا کوچک و متوسط با وجود چند مرحله تایید مطالبات منتظر امضا و ارسال صورتجلسات پرداخت ارز مطالبات سنواتی خود توسط وزیر جهاد کشاورزی هستند.
معاون بهبود تولیدات دامی سازمان جهاد کشاورزی استان قزوین گفت: فعالان دام و طیور استان می‌توانند با ثبت نام در سامانه بازارگاه نسبت به تهیه نهاده‌های دامی خود اقدام کنند.
بسیاری از مسئولان و دست اندرکاران بخش کشاورزی براین باورند که سامانه بازارگاه نه تنها در شفافیت تاثیری نداشت، بلکه به سبب دخالت در آن مشکلاتی ایجاد کرد.
معاون وزیر جهاد کشاورزی گفت: ۸۵ درصد از خدمات وزارت جهاد کشاورزی، به پنجره خدمات دولت الکترونیک متصل شده و تنها سامانه بازارگاه باقی مانده که تا یک ماه آینده به این سامانه متصل خواهد شد.
واردکنندگان، نهاده دامی را با هر کیفیتی وارد و در سامانه بازارگاه ثبت می‌کنند که دامداران و مرغداران نسبت به بی کیفیتی خوراک دام و طیور گلایه‌مند هستند.
با گذشت ۶۰روز از تحویل ۴۶۰ هزار تن نهاده دامی به نرخ ارز ترجیحی توسط ۲۰ شرکت بخش خصوصی از طریق سامانه بازارگاه وعده‌ها در خصوص تامین فوری ارز این محموله‌ها محقق نشده است.